秘密森林是位于煤矿森林左上角的一个隐藏区域,一开始有着一个大圆木阻挡玩家前进的道路,将斧头工具升级至钢斧头才能将大圆木清除。玩家也可以利用卡椅子的方法,提前进入秘密森林中,将农舍自带的椅子收入背包,利用角色互动范围的机制,将椅子放在大圆木后面,之后互动椅子坐上,再从椅子下来,就能垮过大圆木直接来到入口处进入。
提早进入秘密森林有着很多好处,在春季秘密森林会生成野山葵、羊肚菌、普通蘑菇这些采集物,它们都可以用于售卖或者完成收集包的献祭。春季的秘密森林有着绿色史莱姆生成,春一玩家用镰刀就可以将其击败,除了有着和其他史莱姆相同的掉落物,秘密森林里的史莱姆还有一定概率掉落桃花心木树种子,直接售卖能得到100金,将其种下可以长出桃花心木树,完全成长后用斧头砍伐就能得到硬木资源。
秘密森林内一共有六个可再生的大树桩,移除大树桩只需要铜品质的斧头,移除后得到一定数量的硬木和较高的采集经验,同样有概率掉落桃花心木种子。被移除的大树桩在第二天就会在同样位置刷新,除了能直接看到的四个大树桩,另外两个大树桩是在秘密森林的隐藏区域中,穿过南面的两个秘密通道就可以来到隐藏区域,这里有时也会刷新一些史莱姆。